Q1:扩增无产物或产物量少?
A1:
1) 模板降解或模板纯度差。电泳检测模板质量,使用高质量模板;
2) 模板浓度过低。适当增加模板用量;
3) 引物不合适。优化引物设计;
4) 退火温度不合适。设置退火温度梯度,摸索合适的退火温度;
5) 循环数过少。适当增加5~10个循环;
6) 延伸时间不足。复杂模板可适当增加延伸速度至20~30 s/kb。
Q2:扩增出现非特异条带或弥散带?
A2:
1) 引物特异性差。优化引物,避免非特异性条带以及引物二聚体的扩增;
2) 引物浓度过高。降低引物浓度;
3) 模板过量或纯度差。减少模板量,使用高质量模板;
4) 退火温度过低。适当提高退火温度或使用Touchdown PCR程序;
5) 循环数过多。减少循环数至25~30 cycles。