Q1:逆转录后的 cDNA 产物进行 qPCR 检测,CT 值偏高?
A1:
1) 模板 RNA 提取失败或存在降解。建议在逆转录反应前一定要电泳验证 RNA 的完整性,提取 RNA 后尽快进行逆转录及 qPCR 操作;
2) 基因表达量较低。可适当提高模板 RNA 用量。
Q2:逆转录后进行 qPCR,熔解曲线非单一峰?
A2:
1) RNA 模板中含有 gDNA。建议逆转录前进行去基因组反应或引物跨内含子设计;
2) qPCR 引物特异性差。重新设计特异性较好的引物,可通过常规 PCR 检测引物特异性;
3) 引物过量。引物过量可能形成引物二聚体,建议按说明书推荐用量添加;
4) 体系可能存在污染。设置无模板阴性对照(NTC)检查体系是否存在污染,若存在污染,建议更换试 剂及耗材,使用核酸清洁剂清洁(目录号:ND709)操作台面及实验环境中的气溶胶污染。
Q3:反转录产物 PCR 扩增无条带?
A3:
1) PCR 体系不佳。可以先用内参引物进行扩增,可以成功扩增说明目的基因引物欠佳或反转录产物质量 欠佳;如果内参引物不能扩增成功,则有可能 PCR 体系或反转录产物质量欠佳;
2) 模板质量不佳。RNA 发生降解或纯度偏低,建议电泳及测值检查模板质量; (3) 反转录引物使用不当。对于不含 poly(A)的 RNA,建议使用随机引物或特异性引物。
Q4:总 RNA 反转录产物电泳观察不到?
A4:
反转录产物是由模板反转录得到的,模板量本身比较低,反转录产物的量更低于模板量,且反转录产物大 小不均匀,因此电泳是观察不到的。