Q1:逆转录后的cDNA产物进行qPCR检测,CT值偏高?
A1:
1)模板 RNA 提取失败或存在降解。建议在逆转录反应前一定要电泳验证 RNA 的完整性,提取RNA 后尽快进行逆转录及 qPCR 操作;
2)基因表达量较低。可适当提高模板RNA用量;
3)逆转录体系、程序或加样等操作不当。建议按照说明书规范操作。
Q2:逆转录后进行 qPCR,熔解曲线非单一峰?
A2:
1)RNA 模板中含有 gDNA。建议逆转录前进行去基因组反应或引物跨内含子设计;
2)qPCR 引物特异性差。重新设计特异性较好的引物,可通过常规 PCR检测引物特异性;
3)引物过量。引物过量可能形成引物二聚体,建议按说明书推荐用量添加;
4)体系可能存在污染。设置无模板阴性对照(NTC)检查体系是否存在污染,若存在污染,建议更换试剂及耗材,使用核酸清洁剂清洁(目录号:ND709)操作台面及实验环境中的气溶胶污染。